بالنسبة لمرض استسقاء الدماغ فيحدث تراكم السائل الدماغي لعدة اسباب فقد يكون هناك زيادة في انتاج السائل الدماغي حيث يفوق مقدرة الدماغ على امتصاصه ، قصور في عملية الامتصاص او بسبب وجود عائق في مرور السائل من بطين دماغي الى اخر وهذه الاسباب اما ان تكون ناتجة عن وجود عيب خلقي او نتيجة مرض مكتسب فاستسقاء الدماغ قد يكتشف قبل الولادة بواسطة الاشعة الصوتية كما ان استسقاء الدماغ قد يصاحب عيوب خلقية في المخ او في الجسم كوجود كيس غشاء الاعصاب في اسفل الظهر حيث غالبا مايحصل استسقاء الدماغ مصاحبا لهذا العيب الخلقي او قد يحصل بعد استئصال كيس غشاء الاعصاب كذلك قد يحصل بسبب عيب خلقي لتصريف سائل الدماغ ( ضيق في القناة التي تربط البطين الثالث بالرابع ) اما بالنسبة للاسباب المكتسبة لاستسقاء الدماغ فقد تكون نتيجة التهاب السحايا ، ورم في الدماغ او نتيجة اصابة في الرأس